朱九真武功，却懒得理会教务这俗事，亏得有朱长龄、卫璧这心思灵便之辈，又有张无忌私甚广，四游走，倒也很是稳当。此时元朝天灾*，民不聊生，朱九真便说要约齐教众，齐抗元朝，听得杨逍、五散人等人暗暗称奇，佩服她为女竟能有如此襟，齐心协力为之筹划，在蝴蝶谷举火起事。

数年之后，张无忌九神功小成，内寒毒也已肃清。朱九真趁着这当只去了波斯，将圣火令取回。

诸派因为明教的援助，损失甚小，只有峨眉派，在混之中遗失了倚天剑，朱九真态度恳切，言说一定会代为寻回，奈何灭绝师太一向对明教成见甚，冷哼一声，拂袖而去。

说着，竟将太祖的那“星星之火，可以燎原”、“农村包围城市”、“论游击战术”、“团结一切可以团结的力量”等一观念拿了来，用当时的大白话写了，一一分给诸人。

朱九真也不戳破，任由他们心怀鬼胎。且正式接了教主之位，方装作无意间，引着杨不悔发现了山中密和天夫妇的尸。

众教众慌忙应诺，齐声：“不敢有负教主教诲！”

送走了众教众，朱九真正神间，猛然间听到杨逍恭声问：“教主意何往？”

朱九真看了张无忌一，笑：“自然是去海外迎回金狮王谢逊了！他为本教法王，本教正值用人之际，怎能远避海外独自逍遥？”

因事先好了各大门派的关系，此番起事，再无阻碍，武林正派与明教，地主豪与佃农夫，联合起来，共同讨伐蒙古鞑。

由于朱九真料敌先机，赵对六大派伺机下手，却嫁祸明教的这行为，自然被早早识破。每当六大派中人遭遇十香散暗算，被蒙古人秘密送往大都后，朱九真总会率人前往截杀，顺便了却旧怨，修成新好。赵气的咬牙切齿，在朱九真大武力碾压之下，无可奈何。

朱九真想了想，肃然：“大家既是同教兄弟，理应以大局为重，断然不可为了贪图功劳，兄弟互相算计、自相残杀的举动。须知先攘外，后安内，哪怕同教兄弟之间有什么纷争，大可驱逐鞑虏之后，徐徐图之。”

原来因天神秘失踪的关系，明教一直内讧，白眉鹰王殷天正自立天鹰教，杨逍独占光明，五散人听调不听宣，局面甚是胶着。因朱九真是个年轻貌的姑娘，杨逍便灵机一动，提由她担当教主，实则存了欺负她年弱无知的意思。其余殷天正、五散人等皆是怀着相似的心思。

朱九真见台下朱元璋面诚恳，叫的比谁都响亮，心下暗暗发笑，知他们欺负自己是女，哪怕夺得江山，也只是为人作嫁，这才这般笃定。她也不破，只是暗暗留意，心中却另外存着计较。

此时朱九真算定诸大门派即将围攻光明，带着张无忌和殷离上了光明，先是手救下五行旗，后力挫六大派，赢得了明教诸位英雄的叹服。她趁打铁，调和了殷离和殷野王的父女矛盾，又引张无忌见过了外公殷天正，引得天鹰教上下对她恩德，当场便被立为明教的教主。

她有备而来，自然早早伪造了天遗书，上面将谢逊代理教主一段略去不提，只是说迎回圣火令者便是新教主。

朱九真对徐达、常遇等明教将领说：“昔年郭靖郭大侠义守襄，有武穆遗书助他用兵。今朝武穆遗书不知落何方，待我细细找寻。但上天助我，亦有一位用兵行家写就的战略战术论，可供诸君一观。”

又柔声问张无忌：“无忌，事到如今，你总该相信我对你和你义父没有恶意了吧？现在我有一件要为难的事，非要请你义父金狮王谢逊面不可。难到了这个时候，你还不愿把你义父的下落告知我吗？”

不动心。

待到这封书信被宣扬的合教皆知的时候，她才装作不留神，拿明教至宝圣火令，扬言是无意之中得到的。这下明教众人对她更为推崇，叹上天注定。

从此红梅山庄便成为朱九真训练私兵的场所，常见山庄外人喊嘶，忙作一团。张无忌被要求继续学习九神功，殷离则改练了一适合她的女功法，这些功法招式自然还是天龙世界里琅环玉。中的珍藏。卫璧因为伺候朱九真伺候的好，便蒙她传授了黛绮丝的几十年功力，又教给他明火静功和打狗法。他是个乖觉人，索和武家淡了往来，日日到朱九真这里报到。